江西中医药大学创新创业学院成立于2016年5月，独立设置的正处级管理型学院。主要负责全校大学生创新创业教育的总体规划和实施。具体负责创新创业师资队伍建设，创新创业教育课程设计、组织与实施，大学生创新创业实践活动的组织与指导，大学生创业园、创业孵化基地建设，创新创业教育理论与实践研究及对外交流等工作。

学院内设综合办公室、实践教育中心、项目推广中心等3个正科级机构，以及创业就业指导教研室。

近年来，学校先后被评为全国第二批深化创新创业教育改革示范高校、全国创新创业典型经验高校、国家级创新创业教育实践基地、中国大学生iCAN创新创业实践教育基地、全国大学生KAB创业教育基地等，以及江西省大学生创新创业示范基地、江西省第二批大众创业万众创新示范基地等。

成果被教育部《敢闯会创，筑梦未来——新时代中国高校创新创业教育发展报告》《2017年江西教育年鉴》等收录，获江西省教学成果一等奖，入选为全国大学生创新创业实践联盟优秀案例。学生参加中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛共获国赛金奖2项、银奖6项、铜奖25项的好成绩。

江西中医药大学现代产业学院成立于2021年6月，独立设置的正处级管理型学院。2022年8月，被列为首批江西省普通本科高校现代产业学院立项建设项目（重点）。

学院内设行政事务部、教育实践部等2个正科级机构。